시도가 미오와 마주하고 마음을 전하는 사이, 웨스트코트는 엄청난 술식을 발동시키고 있었다. 시도와 토오카 일행은 웨스트코트의 계획을 저지할 수 있을 것인가--?

DEM에 의해 궁지에 몰린 시도 일행은 죽었다고 생각했던 쿠루미의 도움을 받는다.하지만 다음에는 미오가 나타났다. 신지에게 집착하는 미오를 본 시도는 그녀를 구하기 위해서 어떤 방법을 생각해냈는데.

시도는 옛날 타카미야 신지와 미오가 데이트를 했던 해변으로 레이네를 데려갔다. 레이네의 호감도가 상승해서 시도는 결국 그녀와 키스했다. 두 사람의 데이트를 지켜보던 코토리 일행도 데이트의 성공을 확신했는데......

아직 DEM과의 결전이 시작되기 전으로, 아직 아무도 죽지 않은 시간으로 시도는 돌아왔다. 같은 미래를 되풀이하지 않기 위해서 시도는 미오=레이네에게 데이트를 신청한다. 시도로부터 사정을 듣게 된 코토리와 다른 정령들은 두 사람의 데이트를 서포트하기로 했는데.

미오로부터 정령들이 모두 죽었다는 말을 듣고, 깜짝 놀라는 시도. 망연자실하여 움직이지 못하는 상태에서 미오에 의해 시도로서의 기억을 잃게 될 뻔하지만 아직 단 한 명의 살아남은 정령이 있었는데.

미오의 아인 소프 오르에 의해 다수의 정령들이 힘이 다해 쓰러지고 말았다. 코토리는 <프락시너스>를 미오에게 향하게 하고 정령영력포 <궁니르>를 발사했는데.....

토오카 일행이 있는 곳으로 서둘러 가던 시도의 앞을 웨스트코트가 막아선다. 한편, 토오카 일행은 미오가 현현시킨 천사<만상성당 (아인 소프 오르)>의 무시무시한 힘 앞에 속수무책으로 궁지에 몰리고 있었는데......

갑자기 눈앞에 나타난 소녀를 계기로 시도는 많은 기억이 되살아났다. 소녀의 이름은 타카미야 미오. 시도가 타카미야 신지였을 때 마음을 나눈 상대였다. 한편, <프락시너스>의 코토리 일행도 레이네의 정체를 알게 되면서 소란이 일었는데.

어느 때, 어느 장소, 타카미야 신지는 공간진을 조우하는데 그 현장에서 여자아이를 발견했다. 자신에서 대한 걸 거의 아무것도 기억하지 못하는 그녀에게 신지는 미오라는 이름을 붙여주었고, 신지와 신지의 여동생인 마나와 함께 살게 되었는데.

<라타토스크>와 DEM의 전면 대결이 시작됐다. 쿠루미와 그녀의 분신체들, 쿠사카베 료코가 이끄는 AST도 참전하면서 전투가 격렬해지는 가운데, 시도는 <니벨코르>의 대군과 대치하게 되었는데.

DEM과의 전투를 앞두고 분주하지만 사기를 북돋으며 준비에 임하는 <프락시너스>의 크루들. 시도와 동료들을 격려하기 위해 새참을 만드는 정령들. 결전의 시간은 시시각각 다가오고 있었는데......

공중 전함 <프락시너스>의 함교에 모인 코토리와 토오카 일행은 지금까지 쿠루미가 204번 시간을 되돌려 시도를 구했다는 사실을 듣게 된다. 그리고 시도는 타카미야 미오가 누구인지 자신의 기억 속에서 찾아 보려고 했는데....